Lain es una chica de 14 años muy introvertida, y según sus propias compañeras, poco "adulta". Según la voz que escuchamos al principio de cada episodio, "hoy y ahora", llega a clase y encuentra llorando a una chica. El motivo de su llanto es un e-mail que le han enviado (no solo a ella) probablemente unos bromistas, haciéndose pasar por Chisa Yomoda, una chica que se suicidó la semana pasada. Sus amigas le aconsejan que chequee el correo cuando llegue a casa, y eso hace; en efecto, Lain también ha recibido el mensaje de Chisa. Pero no parece que sea obra de bromistas. En el e-mail, Chisa le dice que aunque ya no conserva su cuerpo, no está muerta y que aunque ahora no lo comprenda, lo comprenderá... al igual que todos los demás. Después de este suceso, Lain comienza a interesarse en la Wired (el mundo paralelo, creado por las redes de comunicación) y los Navis (computadoras). Hasta el punto de convencer a su padre para que le compre uno nuevo, más potente, al que equipará con el misterioso procesador de Psyque. A todo esto hay que sumarle el que en club llamado Cyberia encuentre a una chica idéntica a sí misma pero con un carácter totalmente distinto, y la aparente relación entre un nuevo juego en red, la muerte de Chisa y la de varios chicos más (de astroteam).
Episodio 01 - La Red
Episodio 02 - Chicas
Episodio 03 - Psique
Episodio 04 - Religión
Episodio 05 - Distorsión
Episodio 06 - Chicos
Episodio 07 - Sociedad
Episodio 08 - Rumores
Episodio 09 - Protocolo
Episodio 10 - Amor
Episodio 11 - Infornografía
Episodio 12 - Paisaje
Episodio 13 - Ego
