La serie trata sobre un joven, el mejor asesino de la era Tokugawa hasta la Restauracionde Meiji (apodado Bottausai). Este asesino llamado Keshin Himura, decide no asecinar mas a las personas. Y para poder pagar de alguna forma los asecinatos que cometio decide apoyar y cuida a las personas de su alrededor con su tecnica mas poderosa (El Hiten Mitsurugi Ryu).

1. El batusai Himura, el espadachin legendario
2. Yahiko Myoujin, el estudiante indomable
3. El hombre que mato el pasado
4. Solo el mal camino es el correcto, guerrero Sanosuke
5. La espada de doble filo versus la espada Zanba
6. El visitante de las sombras
7. Duelo en plenilunio
8. La mujer misteriosa y el nuevo combate
9. Los mas poderosos cuerpos de asalto
10. Aoshi, tan impresionante que es casi hermoso
11. La batalla de la luz y la obscuridad
12. Nace un espadachin, el combate de Yahiko
13. Toramaru, el luchador de Sumo
14. La doctora Megumi al rescate
15. Dos espadachines legendarios
16. La espada secreta de Shilem
17. Marimo, la bala humana
18. Corre Yahiko, recupera la espada sin filo
19. El reino prohibido
20. El estilo Shinko, renace la espada asesina
21. La destruccion de una pesadilla, la ambicion de Raiyuta
22. Incidente en la locomotora del ferrocarril
23. Sanosuke y los retratos a color
24. Kenshin y Sanosuke se enfrentan de nuevo
25. El pirata rojo separa a Kenshin y a Kaoru
26. Shura, la misteriosa mujer pirata
27. Los ultimos dias del pirata rojo
28. El regreso del lobo: Prólogo de una guerra sangrienta
29. El más poderoso enemigo, colmillo al ataque
30. La venganza del demonio, un complot de Makoto Shishio
31. La partida de Kenshin, realidad inaceptable
32. El viaje de Kaoru a Kioto
33. La obsesión de Aoshi
34. Misao Makimashi, la ladronzuela
35. La aldea abandonada
36. Se acerca el fin de la era Tokugawa. Shishio y Kenshin frente a frente
37. Soujiro contra Kenshin: La espada sin filo se rompe
38. El entrenamiento de Sanosuke
39. La última espada de Shako
40. Combate mortal con Shoo, uno de los 10 asesinos
41. Encuentro con el maestro Seijuro
42. Aoshi y Shishio: aliados
43. Un principio secreto
44. El Juppongatana
45. Detengan el Rengoku
46. Destrucción del Rengoku
47. El puño de Sanosuke
48. La conversión de Anyi
49. El duelo de Saito y Usui
50. El reencuentro de Kenshin y Aoshi
51. Aoshi contra Kenshin, la batalla final
52. El milagro
53. La superpelea
54. El poder de Soujiro
55. El pasado de Soujiro
56. El último ataque de Soujiro
57. Shisio contra Kenshin
58. Kenshin en peligro
59. Resurrección
60. Shishio contra Kenshin, la última batalla
61. El Juppongatana, una acción de vida
62. Regreso a casa
63. La leyenda del fuego volador
64. ¿El nacimiento del príncipe Yahiko?
65. Notaro, el famoso perro detective
66. ¿Una propuesta de Kenshin?
67. La espada legendaria
68. El medallón del destino
69. El momento de la verdad
70. Kenshin Sepultado en la obscuridad
71. Shogo atrapado
72. El triste pasado de Shogo y Sayo
73. El demonio despreciable
74. El adios definitivo
75. El enfrentamiento de los dos Amakakeru Ryu no Hirameki
76. La partida
77. Aparece otro Battusai
78. Una dama admirada por un estudiante de artes
79. El destino de dos sujetos que vivieron al final de la era Tokugawa
80. El final sin fin de la era Tokugawa
81. Un fantasma del final de la era que trata de asesinar a Kaishu
82. La verdad más allá de la era
83. El regreso de Yutaro
84. El grupo ninja Sanada y la medicina milagrosa
85. Una trampa en el cruce de Dios
86. Kaita ve la verdad
87. Schneider defiende a Misanagi
88. Las cenizas de la medicina sagrada
89. Para mi ángel Misao de Kioto
90. El Ki, espada de doble filo
91. El principio del fin
92. Liberación del Ki
93. Partes del rompecabezas
94. El Ki cambia de rumbo y muere
95.-Especial

Rutouni Kenshin: Tsuiokuhen:
(OVA 1)
(OVA 2)
(OVA 3)
(OVA 4)

Rurouni Kenshin: Seisohen:
(OVA 1)
(OVA 2)

Ishin Shishi e no Requiem (pelicula)